O déficit do regime de previdência do servidor público atingiu R$ 35,13 bilhões em 2006 pelos dados da Secretaria do Tesouro Nacional, com crescimento de 6,5% em relação ao registrado em 2005 (R$ 32,99 bilhões). Segundo reportagem do jornal "Valor Econômico", no setor público federal há 537.624 aposentados e 434.333 pensionistas.
Estes números mostram forte desequilíbrio em relação ao rombo do Regime Geral de Previdência Social, que teve um déficit em 2006 de R$ 42,065 bilhões, mas envolve 21,6 milhões de aposentados do setor privado.
Para cada inativo do setor público, o déficit previdenciário foi de R$ 36.143 em 2006. Já para cada aposentado ou pensionista do setor privado, o déficit no mesmo período foi de R$ 1.947. Ou seja, o déficit previdenciário por beneficiário é 18 vezes maior no setor público do que no Regime Geral.
Para tentar reduzir o desequilíbrio foi aprovada em 2003 a reforma constitucional, que pretendeu promover a isonomia entre aposentadorias do setor privado e do setor público e criar fundos de previdência complementar para o funcionalismo dos três Poderes (Executivo, Legislativo e Judiciário). Mas, as novas regras ainda não foram regulamentadas.