O Ministério Público do Distrito Federal entrou com duas ações na Justiça Federal para anular o edital do Trem-Bala ligando Campinas-SP-RJ. O leilão de uma primeira etapa do projeto está previsto para agosto de 2013. Os procuradores apontam diversas irregularidades no edital da concorrência. Entre elas, a de que os estudos de viabilidade do projeto estão defasados: foram feitos em 2008, com dados de 2007, o que pode levar a erros de estimativas e "prejuízos bilionários".Outro problema apontando pela procuradoria é a falta de punição expressa no edital para a empresa que tentar burlar uma das cláusulas da concorrência que prevê uma estimativa de custos para a construção de pontes, viadutos e túneis.
Pelo edital, cada concorrente terá que apresentar uma estimativa de quanto custará a construção desses trechos do trem-bala com o equipamento que será usado por ela. Como cada trem tem peso e tamanho diferente, os custos para essas construções são também diferentes.Quanto mais baixo o valor da obra, maior as chances do concorrente de vencer a disputa porque ganha quem oferecer o maior valor de pagamento ao governo, descontado o custo de construção. Para os procuradores, não há no edital previsão de punição para o caso de haver uma subestimação de custo por parte do vencedor.
Essa cláusula também foi motivo de advertência do Tribunal de Contas da União (TCU) quando analisou pela última vez a proposta de edital do trem-bala, apontando os mesmos problemas dos procuradores. O governo chegou a cogitar tirar essa regra do edital publicado em dezembro, mas ela acabou mantida.
Outro problema apontado pelo MP na ação é o alto grau de participação pública no projeto, estimado em até 45%, além de um financiamento do BNDES de até 60% da parte que caberá aos vencedores da licitação. Antes, o participação estatal estava prevista em 30%. Na primeira tentativa de licitar o trem-bala, em 2011, o MP também entrou com ação contra o governo tentando impedir o leilão. Mas a Justiça negou liminar e, como o leilão foi cancelado, não julgou o mérito da questão.
O trem-bala entre Campinas-SP-RJ está estimado em R$ 34 bilhões (a preço de 2009). Após a primeira tentativa de leiloá-lo ter fracassado por falta de empresas interessadas, o governo refez o projeto e decidiu dividir a licitação para o projeto em duas. A primeira, marcada para agosto, vai escolher a empresa que vai comprar os equipamento e operar o trem. Essa empresa vai arrecadar o dinheiro das passagens e repassar um percentual ao governo.
O governo pretende, com esse dinheiro, contratar uma outra empresa para construir a linha do trem e as estações. A forma de contratação dessa segunda companhia ainda não está definida. A primeira opção é fazer uma concessão para escolher uma empresa que receberá uma espécie de aluguel pela linha e estações ao longo do período da concessão. A segunda é contratar empreiteiras para fazer uma obra pública.