O PAC não apresentou nenhuma medida direta ao agronegócio, mas atingirá o setor indiretamente por meio dos investimentos em infra-estrutura, foco do programa. Os investimentos na área de infra-estrutura logística que podem beneficiar o agronegócio correspondem a pouco mais de 10% do montante de recursos anunciados. Pelo programa, o governo vai destinar R$ 58,3 bilhões em quatro anos para a construção e ampliação de rodovias, ferrovias, portos, aeroportos e rodovias.
Por esse motivo, o agronegócio começará a sentir os efeitos apenas na próxima safra, a 2007/08, já que o tempo seria curto para trazer benefícios ainda na safra 2006/07.
Na avaliação do consultor José Hausknecht, da MB Associados, o PAC não provocará impactos diretos sobre o agronegócio, mas contribuirá para a redução dos custos de logística. "Os investimentos em infra-estrutura que o governo pretende fazer podem reduzir os custos, principalmente para as regiões mais afastadas dos portos."