As Eliminatórias da África do Sul são compostas de três fases. Os 24 times de pior colocação no ranking jogam uma espécie de pré-eliminatória no sistema mata-mata - a desistência de Ilhas Maurício fez a Libéria avançar automaticamente.
Contando com os 12 classificados, 48 seleções são separadas em 12 chaves de 4 concorrentes cada. Campeões e oito vices avançam para a fase final, na qual são dispostos em 5 grupos de 4 equipes. Os vencedores desses grupos estarão no Brasil.
1.ª fase11/11/11São Tomé e Príncipe 0 x 5 CongoDjibuti 0 x 4 NamíbiaComores 0 x 1 MoçambiqueEritreia 1 x 1 RuandaGuiné Equatorial 2 x 0 MadagascarChade 1 x 2 TanzâniaGuiné-Bissau 1 x 1 TogoSeychelles 0 x 3 QuêniaSuazilândia 1 x 3 RD do CongoLesoto 1 x 0 Burundi12/11/11Somália 0 x 0 Etiópia
15/11/11 Madagascar 2 x 1 Guiné Equatorial*RD do Congo* 5 x 1 SuazilândiaTogo* 1 x 0 Guiné-BissauBurundi 2 x 2 Lesoto*Ruanda* 3 x 1 EritreiaCongo* 1 x 1 São Tomé e PríncipeQuênia* 4 x 0 SeychellesTanzânia* 0 x 1 ChadeMoçambique* 4 x 1 ComoresNamíbia* 4 x 0 Djibuti16/11/11Etiópia* 5 x 0 Somália
* Classificados