- As primeiras suspeitas contra o deputado José Dirceu (PT-SP) foram levantadas em 2002, quando Celso Daniel, prefeito de Santo André (SP), foi seqüestrado e, dois dias depois, encontrado morto.
- De acordo com os irmãos do prefeito, João Francisco e Bruno Daniel, o crime acorreu devido ao envolvimento de Celso Daniel com um esquema de arrecadação de recursos de empresas de ônibus para um suposto caixa 2 do PT. Quem receberia esses recursos em Brasília seria José Dirceu.
- Em fevereiro de 2004, novas suspeitas contra o deputado foram levantadas quando Waldomiro Diniz, seu assessor e braço direito, foi exonerado do cargo de subchefe de Assuntos Parlamentares da Presidência da República sob a acusação de negociar com bicheiros.
- Diniz foi denunciado por facilitar concorrências para o empresário do jogo Carlos Augusto Ramos, o Carlinhos Cachoeira, em troca de propinas e contribuições para campanhas eleitorais.
- Em junho de 2005 surgiu a denúncia mais pesada. José Dirceu foi acusado pelo deputado cassado Roberto Jefferson (PTB-RJ) de ser o mentor de um suposto esquema de pagamento de mesadas a deputados em troca de apoio político, o chamado mensalão.
- O esquema seria operado pelo publicitário Marcos Valério Fernandes de Souza. Nessa época, Dirceu estava licenciado do cargo de deputado e ocupava o Ministério da Casa Civil, mas continuou recebendo o seu salário do Congresso, motivo pelo qual é também acusado de quebra de decoro parlamentar.