A boa trajetória de Cidade Baixa começou com a seleção para a mostra paralela Un Certain Regard do Festival de Cannes 2005, onde recebeu o Prêmio da Juventude.
No início de outubro de 2005, o filme foi o grande vencedor do Festival do Rio, recebendo também o prêmio de melhor atriz para Alice Braga.
O longa de Sérgio Machado ainda foi lauredo como melhor filme no Festival Latino de Los Angeles (EUA) e ganhou os troféus de melhor longa-metragem, filme de novo realizador, ator (Wagner Moura) e roteiro do Festival de Cinema Ibero-Americano de Huelva (Espanha).
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