Início
A primeira equipe treinada por Paulo Autuori foi o Nacional da Ilha da Madeira, de Portugal, entre 1987 e 1989. Ele tinha 31 anos. Antes de retornar ao Brasil, comandou ainda o Vitória de Guimarães e o Marítimo.
Campeão brasileiro
Ainda desconhecido no país, o técnico assume o Botafogo e conquista o Campeonato Brasileiro em 1995 derrotando o Santos na decisão. Foi a única vez em que levantou a taça do Nacional.
Libertadores
Paulo Autuori foi bicampeão da Libertadores. A primeira conquista ocorreu em 1997, com o Cruzeiro. O segundo sucesso do técnico no torneio continental veio em 2005. Na época, estava à frente do São Paulo e venceu na final justamente o Atlético.
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Mundial
O ápice da carreira de Paulo Autuori foi no São Paulo de 2005. Depois da festa na Libertadores, ele ainda comemorou o tricampeonato mundial do Tricolor, batendo o Liverpool na decisão.
Seleções
O novo treinador do Atlético chegou a tentar a sorte à frente de duas seleções, sem muito sucesso. Depois de ser campeão peruano três vezes com Alianza Lima (Apertura em 2001) e Sporting Cristal (Apertura e Clausura em 2002), ele foi convidado para treinar a seleção do Peru entre 2003 e 2005. Pediu demissão por divergências com a Confederação local. Depois, ainda comandou a seleção olímpica (2011 e 2012) e principal (2012 e 2013) do Catar.
Histórico recente
Entre 2013 e 2015, Autuori passou sem sucesso por Vasco, São Paulo, Atlético-MG e, por fim, Cerezo Osaka (Japão).